内閣府 Bureau du Conseil des ministres
				総合科学技術会議 Conseil pour la Politique Scientifique et Technologique (CSTP)
				原子力委員会 Comité de l'énergie atomique
				原子力安全委員会 Comité de la Sécurité nucléaire
				食品安全委員会 Comité de la Sécurité alimentaire
				経済社会総合研究所 Institut de recherche économique et sociale (ESRI)
				日本学術会議 Conseil des sciences du Japon (SCJ)
		国家公安委員会 Comité national de la Sécurité publique
		警察庁 Agence nationale de la Police		科学警察研究所 Institut national de recherche sur les sciences de police
	総務省 Ministère de l'intérieur et des communications (MIC)
				情報通信審議会 Conseil de l'information et des communications	情報通信技術分科会 Sous-Conseil de la Technologie de l'information et des communications
				情報通信研究機構 Institut national de technologie de l'information et des communications (NICT)	宇宙航空研究開発機構 Japan Aerospace Exploration Agency (JAXA)
		消防庁 Agence de gestion de l'Incendie et des catastrophes (FDMA)		消防大学校 消防研究センター Institut national de recherche sur les incendies et la prévention des catastrophes
	法務省 Ministère de la justice
				法務総合研究所 Institut de recherche et de formation, affilié au Ministère de la Justice
	外務省 Ministère des affaires étrangères
	財務省 Ministère des Finances
				関税中央分析所 Laboratoire central des douanes
		国税庁 Agence nationale des impôts		酒類総合研究所 Institut national de recherche sur le brassage
	文部科学省 Ministère de l'Education, de la Culture, des Sports, des Sciences et de la Technologie (MEXT)
				科学技術・学術審議会 Conseil pour la science et la technologie
				宇宙開発委員会 Commission des activités spatiales
				放射線審議会 Conseil de Radiation
				日本学士院 Académie du Japon
				地震調査研究推進本部 Quartier général pour la promotion de la recherche de Séisme
				日本ユネスコ国内委員会 Commission nationale japonaise pour l'UNESCO
				国立教育政策研究所 Institut national de recherche sur les politiques éducatives (NIER)	科学技術政策研究所 Institut national de la politique scientifique et technologique (NISTEP)
		国立大学法人 Universités nationales		附置研究所 Laboratoires attachés aux universités
				大学共同利用機関 Instituts de recherche interuniversitaires
				国立科学博物館 Musée national des sciences	放射線医学総合研究所 Institut National des Sciences radiologiques (NIRS)
				国立特殊教育総合研究所 Institut national de l'éducation spéciale /spécialisée	防災科学技術研究所 Institut national de recherche pour les sciences de la terre et la prévention des catastrophes (NIED)
				科学技術振興機構 Agence des Sciences et de la Technologie du Japon (JST)	海洋研究開発機構 Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology (JAMSTEC)
				日本学術振興会 Société japonaise pour la promotion des sciences (JSPS)	宇宙航空研究開発機構 Agence Japonaise d'exploration aérospatiale (JAXA)
				理化学研究所 RIKEN (Institut de recherche physique et chimique )	国立オリンピック記念青少年総合センター Institution nationale pour l'éducation des jeunes
				物質・材料研究機構 Institut national pour la science des matériaux (NIMS)	日本スポーツ振興センター Agence nationale pour la promotion de la santé et des sports
				日本原子力研究開発機構 Agence Japonaise de l'énergie atomique (JAEA)
		文化庁 Agence pour les affaires culturelles		日本芸術文化振興会 Conseil des arts du Japon	文化財研究所 Institut national de recherche pour les biens culturels
				国立国語研究所 Institut national de la langue japonaise
	厚生労働省 Ministère de la santé, du travail et du bien-être
				厚生科学審議会 Conseil des sciences de la santé
				国立社会保障・ 人口問題研究所 Institut national de la population et de la recherche sur la sécurité sociale	国立感染症研究所 Institut national des maladies infectieuses
				国立医薬品食品 衛生研究所 Institut national des sciences de la santé	国立保健医療科学院 Institut national de santé publique
				国立がんセンター研究所 Institut de recherche affilié au Centre national du Cancer	国立循環器病センター 研究所 Institut de recherche affilié au Centre national cardio-vasculaire
				国立国際医療センター 研究所 Institut de recherche affilié au Centre international de médecine du Japon	国立成育医療センター 研究所 Institut national de recherche pour la santé et le développement des enfants
				国立精神・神経センター 精神保健研究所、 神経研究所 Institut national de Santé mentale Centre national de neurologie et de psychiatrie/ Institut national des neurosciences
				国立健康・栄養研究所 Institut national de la santé et de la nutrition	労働政策研究・研修機構 Institut japonais pour la politique du travail et de la formation
				医薬品医療機器総合機構 Agence des produits pharmaceutiques et des dispositifs médicaux (PMDA)	医薬基盤研究所 Institut national de l'innovation biomédicale
				労働安全衛生総合研究所 Institut national de sécurité et de santé du Japon
	農林水産省 Ministère de l'agriculture, des forêts et des pêches (MAFF)
		農林水産技術会議 Conseil de recherche d'Agriculture, de sylviculture et de pêche (AFFRC)
				農林水産政策研究所 Institu de Recherche politiques, Ministère de l'agriculture, de la forêt et de la pêche (PRIMAFF)
				農業・食品産業技術総合研究機構 Organisation nationale de recherche d'Agriculture et d'Alimentaire (NARO)	農業工学研究所 Institut national de génie rural (NIRE)
				農業生物資源研究所 Institut national des sciences agrobiologiques (NIAS)	食品総合研究所 Institut national de recherche alimentaire (NFRI)
				農業環境技術研究所 Institut national des sciences agroenvironnementales (NIAES)	国際農林水産業 研究センター Centre japonais de la recherche internationale pour les sciences agricoles (JIRCAS)
		林野庁 Agence forestière		森林総合研究所 Institut de recherche sur la fôret et les produits forestiers (FFPRI)
		水産庁 Agence de pêche		水産総合研究センター Agence de recherche sur la pêche (FRA)
	経済産業省 Ministère de l'Economie, du Commerce et de l'industrie (METI)
				産業構造審議会 Conseil de la structure industrielle
				産業技術総合研究所 National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (AIST)	原子力安全基盤機構 Organisation japonaise de Sécurité d'énergie nucléaire (JNES)
				製品評価技術基盤機構 Institut national de technologie et d'évaluation (NITE)	情報処理推進機構 Agence pour la promotion des Technologies de l'information (IPA)
				石油天然ガス ・金属鉱物資源機構 Corporation nationale du Japon pour le pétrole, gaz et métaux (JOGMEC)	工業所有権情報・研修館 Centre national de formation et d’information en propriété industrielle (NCIPI)
				新エネルギー・産業技術総合開発機構 Organisation du développement des nouvelles énergies et techniques industrielles (NEDO)	中小企業基盤整備機構 Organisation du Commerce et de I’ Industrie pour les Petites et Moyennes Entreprises et I’ Innovation régionale du Japon (SMRJ)
		資源エネルギー庁 Agence des ressources naturelles et de l'énergie
		原子力安全・保安院 Agence de la sécurité nucléaire et industrielle (NISA)
		特許庁 Office des brevets du Japon (JPO)
		中小企業庁 Agence pour la Promotion et l'Appui aux Petites et Moyennes Entreprises
	国土交通省 Ministère du Territoire, des Infrastructures et des Transports (MLIT)
				交通政策審議会 Conseil pour la politique des transports
				国土技術政策総合研究所 Institut national pour la gestion de la terre et de l'infrastructure
				国土地理院 Institut de surveillance géographique
				土木研究所 Institut de recherche des travaux publics	港湾空港技術研究所 Institu de recherche Portuaire et Aéroportuaire
				建築研究所 Institut de recherche en construction	鉄道建設・運輸施設整備支援機構 Agence japonaise de construction, transport et technologie des chemins de fer (JRTT)
				交通安全環境研究所 Laboratoire National de la sécurité du trafic et de l'environnement	宇宙航空研究開発機構 Japan Aerospace Exploration Agency (JAXA)
				海上技術安全研究所 Institut national de recherche maritime	電子航法研究所 Institut de recherche de navigation électronique
		海上保安庁 Garde côtière japonaise		海洋情報部 Département hydrographique et océanographique
				海上保安試験研究センター Centre de Recherche de la Garde côtière
		気象庁 Agence météorologique		気象研究所 Institut de recherche météorologique
	環境省 Ministère de l'Environnement
				中央環境審議会 Conseil central de l'Environnement
				環境調査研修所 Institut National de recherche et de formation sur l'environnement	国立水俣病 総合研究センター Institut national de la maladie de Minamata
				国立環境研究所 Institut national des études environnementales (NIES)
	防衛省 Ministère de la Défense
	* L'Agence Japonaise de la Défense est promue au rang du Ministère de la Défense, depuis le 9 janvier 2007

   indique l'Institution administratif indépendante.（独立行政法人）